Да, можно.
    В конфигураторе в плане счетов надо добавить необходимые субсчета (можно только один, после чего остальные можно вводить в рабочем режиме).
После того как введены все необходимые субсчета, в документах они выбираются также как и обычно.
    При создании субсчетов 31.1, 31.2 (и т.д.) автоматически также создается субсчет 31.0, на который переносятся все остатки и движения по счету 31. Дело в том, что счет 31 становится групой счетов, а по группе проводок быть не может.
    Кроме того, не помешает просмотреть список корректных проводок (если Вы им пользуетесь) и дополнить его новыми корреспонденциями.
    Ну и наконец, нужно учитывать что в конфигурации в модулях некоторых документов могут быть прописаны проводки непосредственно со счетом 31. В таком случае следует изменить алгоритм, а может и добавить выбор конкретного субсчета в форме диалога этих документов.